Руководитель:
заведующая кафедрой микробиологии имени В. С. Киктенко медицинского института, кандидат медицинских наук, доцент
Структурное подразделение: Научно-исследовательский институт молекулярной и клеточной медицины медицинского института.
Бактериологическая лаборатория – современная площадка по изучению микробиоты тела человека: от выделения и характеристики иммунобиологических свойств комменсальных бактерий до создания пробиотических препаратов нового поколения.
Ресурсы
Лабораторная база позволяет использовать методы исследования:
- ПЦР
- РТ-ПЦР
- ИФА
- Работа с эукариотическими клетками
- Идентификация микроорганизмов по их метаболическому профилю (система BioLog)
В парке оборудования
- Сухожаровой шкаф Binder ED 240 (Германия)
- Автоклав ГК 100 – 3 (Россия)
- Термостат Being BJ-120TL (Китай):
- СО2-инкубатор Being BPN-40RHP (Китай)
- Шейкер – инкубатор Senova BS-3021 (Китай)
- Система идентификации микроорганизмов BioLog GEN III Omnilog Plus ID System (США)
- Амплификатор для проведения ПЦР в реальном времени QuantGene 9600 (Китай)
- Лиофильная сушка Scientz-F (Китай)
- Аквадистиллятор Liston Model A1210 (Россия)
- Электрофорезная камера Mini-PROTEAN Tetra system BioRad (США)
- Система ячеек Millipore 2,5 L (Германия) и блоков управления Amicron M2000 control (США) для мембранной ультрафильтрации
Команда лаборатории
- Разрабатывает дизайн исследования и совершенствует существующие протоколы для получения оптимального результата
- Использует методы: культуромный, биохимический, молекулярно-генетический методы, клеточные технологии
- Проводит сравнительный анализ данных с использованием международных баз (NCBI; Genebank)
Механика работы: выделить бактерии, проанализировать их характеристики, предложить эффективную модификацию.
Партнеры
- Кафедра микробиологии и вирусологии Институт профилактической медицины им. З.П. Соловьева Российского национального исследовательского медицинского университета имени Н. И. Пирогова
- Культуромные исследования микробиоты тела человека.
- Выделение и сохранение комменсальных бактерий.
- Исследование иммунобиологических свойств комменсальных бактерий с использованием культур клеток.
- Профилирование бактерий по спектру чувствительности к антибиотикам.
- Поиск альтернативных путей преодоления антибиотикорезистентности у бактерий.
- Перспективный результат: разделение комменсальных бактерий по их про- и противовоспалительному профилю, создание коллекции микроорганизмов с известными иммунобиологическими свойствами.
- Область применения результатов: выбор тактики восстановления микробиоты и её модуляции для эффективного лечения онкологических заболеваний.
Изучено влияние Akkermansia muciniphila, изолированных из кишечной микробиоты человека, на экспрессию гена IL-8 в клеточной линии HT-29. Установлено, что исследованные штаммы A. muciniphila обладают штаммо-специфичной иммуномодулирующей активностью. Выявленные отличия в свойствах штаммов должны учитываться при подборе штаммов для создания новых пробиотических препаратов.